Согласно ст. 2 Закона РК О бухгалтерском учете и финансовой отчетности и ст. 202 НК РК ИП, даже если не ведет бухгалтерский учет обязан выписывать первичные учетные документы. А при реализации импортированных товаров, товаров из Перечня изъятий № 59 или из Перечня № 384 ИП обязан выписать ЭСФ в соответствии со ст. 412 НК РК. 

Но если поставщик не выписал документы, то можете вернуть ему этот товар. 

Либо с риском для себя вы оформляете акт инвентаризации и признаете данный товар как выявленные излишки, включаете его стоимость в СГД в соответствии со ст. 238 НК РК как безвозмездно полученное имущество. 

В учете отразится: 

ДТ 1330 

КТ 6290 

Но также при реализации данного товара у вас возникает проблема с определением источников происхождения товара, признак 5 указывать нельзя. Т.е. может возникнуть проблема при реализации товара. 

Если отражена оплата ИП за товар, а документов, подтверждающих факт поставки товара нет, то вам придется еще списать через три года и сумму оплаты за товар за счет чистого дохода компании.