Комплексная проверка - это проверка, проводимая налоговым органом в отношении налогоплательщика (налогового агента), по вопросам исполнения налогового обязательства по всем видам налогов, платежей в бюджет и социальных платежей. (ст. 141 Налогового кодекса РК)

Согласно ст. 138 Налогового кодекса РК - Налоговой проверкой  является проверка, осуществляемая налоговым органом, исполнения норм налогового законодательства Республики Казахстан, а также иного законодательства Республики Казахстан, контроль за исполнением которого возложен на налоговые органы.

Налоговые проверки осуществляются исключительно налоговыми органами.

Налоговые проверки осуществляются в форме комплексной, тематической, встречной проверки, хронометражного обследования.

Согласно ст. 141 Налогового кодекса РК - в комплексную проверку могут быть включены вопросы тематических проверок, в том числе вопросы:

  • исполнения банками и организациями, осуществляющими отдельные виды банковских операций, обязанностей, установленных настоящим Кодексом, а также законами Республики Казахстан ""Об обязательном социальном страховании"", ""О пенсионном обеспечении в Республике Казахстан"" и ""Об обязательном социальном медицинском страховании"";
  • правомерности применения положений международных договоров (соглашений);
  • трансфертного ценообразования;
  • государственного регулирования производства и оборота отдельных видов подакцизных товаров, а также оборота авиационного топлива, биотоплива, мазута;
  • иные вопросы по соблюдению законодательства Республики Казахстан, контроль за исполнением, которого возложен на налоговые органы."

Налоговые проверки при ликвидации (прекращении деятельности) налогоплательщика (структурного подразделения юридического лица) проводятся исключительно в форме комплексной проверки (далее – ликвидационная налоговая проверка).

При снятии с учетной регистрации структурного подразделения юридического лица-резидента комплексная проверка не проводится, за исключением случаев представления налогоплательщиком заявления на проведение такой проверки.

Срок проведения налоговых проверок

Срок проведения налоговой проверки, указываемый в предписании, как указано в ст. 146 Налогового кодекса, не должен превышать тридцать рабочих дней с даты вручения предписания, если иное не установлено статьей 146 НК РК.

Срок проведения налоговой проверки может быть продлен:

1) для юридических лиц, не имеющих структурных подразделений, индивидуальных предпринимателей и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии не более одного места нахождения в Республике Казахстан, за исключением случаев, указанных в подпункте 2) настоящего пункта:

  • налоговым органом, назначившим налоговую проверку, – до сорока пяти рабочих дней;

  • вышестоящим налоговым органом – до шестидесяти рабочих дней;

2) для юридических лиц, имеющих структурные подразделения, и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии более одного места нахождения в Республике Казахстан, а также для налогоплательщиков, подлежащих налоговому мониторингу:     

  • налоговым органом, назначившим налоговую проверку, – до семидесяти пяти рабочих дней;

  • вышестоящим налоговым органом – до ста восьмидесяти рабочих дней.

Срок проведения комплексной или тематической проверки, как указано в п. 6ст. 146 Налогового кодекса, с учетом сроков продления или приостановления, если иное не установлено пунктами 5 и 7 настоящей статьи, не должен превышать:

1) для юридических лиц, не имеющих структурных подразделений, индивидуальных предпринимателей и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии не более одного места нахождения в Республике Казахстан, за исключением случаев, указанных в подпункте 2) настоящего пункта, – шестьдесят рабочих дней;

2) для юридических лиц, имеющих структурные подразделения, и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии более одного места нахождения в Республике Казахстан, а также для налогоплательщиков, подлежащих налоговому мониторингу, – сто восемьдесят рабочих дней.