Налоговая проверка - это проверка, осуществляемая налоговым органом, исполнения норм налогового законодательства Республики Казахстан, а также иного законодательства Республики Казахстан, контроль за исполнением которого возложен на налоговые органы. (ст. 138 Налогового кодекса РК).

Налоговые проверки осуществляются исключительно налоговыми органами.

На основании ст. 140 НК РК налоговые проверки осуществляются в форме:

  • комплексной, 

  • тематической, 

  • встречной проверки, 

  • хронометражного обследования. 

Согласно ст. 142 НК РК тематической проверкой является проверка,  проводимая налоговым органом в отношении налогоплательщика (налогового агента), по вопросам:
1) исполнения налогового обязательства по отдельным видам налогов и (или) платежей в бюджет;
2) исполнения налогового обязательства по НДС и (или) акцизу по товарам, импортированным на территорию РК с территории государств-членов ЕАЭС;
3) определения налогового обязательства по действию (действиям) по выписке счета-фактуры, совершение которого (которых) признано судом осуществленным (осуществленными) без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;
3-1) определения налогового обязательства по взаиморасчетам с налогоплательщиком (налогоплательщиками), в отношении которого (которых) проводится досудебное расследование по факту совершения действий по выписке счета-фактуры без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;
4) определения взаиморасчетов между налогоплательщиком и его дебиторами;
5) правомерности применения положений международных договоров (соглашений);
6) подтверждения достоверности сумм превышения налога на добавленную стоимость, в том числе предъявленных к возврату;
7) подтверждения предъявленного нерезидентом к возврату подоходного налога из бюджета в связи с применением положений международного договора, регулирующего вопросы избежания двойного налогообложения и предотвращения уклонения от уплаты налогов;
8) изложенным в обращении нерезидента, о повторном рассмотрении налогового заявления на возврат подоходного налога из бюджета в связи с применением положений международного договора, регулирующего вопросы избежания двойного налогообложения и предотвращения уклонения от уплаты налогов;
9) неисполнения налогоплательщиком (налоговым агентом) уведомления налоговых органов об устранении нарушений, выявленных по результатам камерального контроля, в порядке, определенном статьей 96 настоящего Кодекса;
10) исполнения требований, предусмотренных статьей 29 настоящего Кодекса;
11) изложенным в жалобе налогоплательщика (налогового агента) на уведомление о результатах проверки;
12) постановки на регистрационный учет в налоговых органах;
13) наличия ККМ или трехкомпонентной интегрированной системы;
14) наличия оборудования (устройства), предназначенного для осуществления платежей с использованием платежных карточек;
15) наличия СНТ и соответствия наименования, количества (объема) товаров сведениям, указанным в СНТ:
при перемещении, реализации и (или) отгрузке товаров по территории РК, в том числе осуществляемых международными автомобильными перевозками между государствами-членами ЕАЭС;
при ввозе товаров на территорию РК с территории государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств-членов ЕАЭС;
при вывозе товаров с территории РК на территорию государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств-членов ЕАЭС;
16) наличия документов, предусмотренных нормативными правовыми актами Республики Казахстан, принятыми в реализацию международных договоров, ратифицированных Республикой Казахстан, при вывозе товаров с территории РК на территорию государств-членов ЕАЭС и соответствия товаров сведениям, указанным в документах;
17) наличия и подлинности акцизных и учетно-контрольных марок, наличия лицензии;
18) наличия товарно-транспортных накладных на импортируемые товары и соответствия наименования товаров сведениям, указанным в товарно-транспортных накладных, при проверке автотранспортных средств на постах транспортного контроля или дорожной полиции;
19) соблюдения порядка применения контрольно-кассовых машин;
20) соблюдения законодательства РК о разрешениях и уведомлениях и условий производства, хранения и реализации отдельных видов подакцизных товаров;
21) исполнения распоряжения, вынесенного налоговым органом, о приостановлении расходных операций по кассе;
22) соблюдения порядка выписки счетов-фактур в электронной форме;
23) подтверждения наличия остатков товаров, включенных в перечень товаров, к которым применяются пониженные ставки таможенных пошлин в связи с присоединением Республики Казахстан к Всемирной торговой организации;
24) неисполнения решения в рамках мониторинга крупных налогоплательщиков;
25) наличия и подлинности на товаре средства идентификации по товарам, подлежащим обязательной маркировке в соответствии с международными договорами и (или) законодательством РК.

Тематическая проверка может также проводиться по следующим вопросам:

1) полноты и своевременности исчисления, удержания и перечисления социальных платежей;
2) исполнения банками и организациями, осуществляющими отдельные виды банковских операций, обязанностей, установленных настоящим Кодексом, а также законами Республики Казахстан "Об обязательном социальном страховании" и "О пенсионном обеспечении в Республике Казахстан", "Об обязательном социальном медицинском страховании";
3) трансфертного ценообразования;
4) государственного регулирования производства и оборота отдельных видов подакцизных товаров, а также оборота авиационного топлива, биотоплива, мазута.
3. Тематическая проверка может проводиться одновременно по нескольким вопросам, указанным в пунктах 1 и 2 настоящей статьи. Тематическая проверка не может предусматривать проведение проверки исполнения обязательства по всем видам налогов и платежей в бюджет.

Срок проведения налоговой проверки не должен превышать 30 рабочих дней с даты вручения предписания.

Срок проведения налоговой проверки может быть продлен:

- для юридических лиц, не имеющих структурных подразделений, индивидуальных предпринимателей и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии не более одного места нахождения в РК,

  • налоговым органом, назначившим налоговую проверку, - до 45 рабочих дней;

  • вышестоящим органом налоговой службы - до 60 рабочих дней;

- для юридических лиц, имеющих структурные подразделения, и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии более одного места нахождения в РК, а также для крупных налогоплательщиков, подлежащих мониторингу:

  • налоговым органом, назначившим налоговую проверку, - до 75 рабочих дней;

  • вышестоящим органом налоговой службы - до 180 рабочих дней.

Правила назначения тематических и встречных проверок и вынесения решения о проведении хронометражного обследования. Приказ Министра финансов Республики Казахстан от 15 февраля 2018 года № 197.