Тематическая налоговая проверка – налоговая проверка исполнения налогового обязательства по отдельным видам налогов и (или) платежей в бюджет и (или) социального обязательства и иных требований Налогового Кодекса и законодательства Республики Казахстан, контроль за соблюдением которого возложен на налоговый орган.

Налоговая проверка - это  проверка исполнения норм налогового законодательства Республики Казахстан, осуществляемая налоговым органом, а также иного законодательства Республики Казахстан, контроль за исполнением которого возложен на налоговые органы.

Тематическая проверка с 1 января 2026 года

Тематическая проверка до 1 января 2026 года

Тематическая проверка с 1 января 2026 года

Новый Налоговый кодекс (Кодекс РК от 18 июля 2025 года № 214-VIII ЗРК) вступил в силу с 1 января 2026 года.

В рамках налоговой реформы изменения, вступающие в силу с 1 января 2026 года, коснулись налоговых проверок.

С 2026 года комплексные налоговые проверки не будут проводиться, если налоговая нагрузка (КНН) у компании составляет 90% или больше от отраслевого максимума по региону.

Проверка возможна только в трёх случаях:

• по заявлению самого налогоплательщика;

• по основаниям, предусмотренным Уголовно- процессуальным законодательством Республики Казахстан;

• по требованию органов прокуратуры.

Формы и виды налоговых проверок

Участники налоговой проверки

Тематическая налоговая проверка

Сроки проведения налоговой проверки

В каких случаях назначается налоговая проверка

Завершение налоговой проверки

Формы и виды налоговых проверок

Налоговый контроль осуществляется путем проведения налоговой проверки исключительно налоговыми органами.

Общий порядок проведения налоговой проверки определяется Налоговым Кодексом, а также Предпринимательским кодексом Республики Казахстан.

Налоговая проверка осуществляется в форме:

• комплексной, 

• тематической, 

• встречной налоговой проверки, 

• хронометражного обследования.

Период, подлежащий налоговой проверке, не должен превышать срок исковой давности.

Налоговые органы вправе осуществлять налоговые проверки структурных подразделений юридического лица независимо от проведения налоговой проверки самого юридического лица.

Налоговая проверка в отношении сотрудников органов, осуществляющих в соответствии с Законом Республики Казахстан "Об оперативно-розыскной деятельности" оперативно-розыскную деятельность, проводится в особом порядке.

Особый порядок проведения налоговой проверки определяется уполномоченным органом совместно со специальными государственными органами, органами военной разведки Министерства обороны Республики Казахстан, правоохранительными органами.

При определении проверяемого периода не включается налоговый период, охваченный аудитом по налогам, при назначении:

1) комплексной налоговой проверки, за исключением назначаемых при реорганизации или ликвидации юридического лица – резидента, структурного подразделения юридического лица – нерезидента;

2) тематической налоговой проверки по налоговому заявлению или жалобе самого налогоплательщика (налогового агента), в том числе:   

• по налоговому заявлению в связи со снятием с регистрационного учета плательщика по налогу на добавленную стоимость;

• в связи с жалобой налогоплательщика (налогового агента) на уведомление о результатах налоговой проверки.

Положение части первой данного пункта не распространяется на налоговые проверки в отношении:

      1) налогоплательщиков, подлежащих налоговому мониторингу;

      2) недропользователей;

      3) налогоплательщиков, осуществляющих виды деятельности по производству и обороту отдельных видов подакцизной продукции, биотоплива.

Налоговая проверка назначается  с учетом показателя коэффициента налоговой нагрузки (КНН).

При этом комплексная налоговая проверка не назначается за налоговый период, в котором у налогоплательщика КНН составляет не менее 90 процентов верхнего показателя КНН по соответствующему виду деятельности и с учетом региона осуществления деятельности.

Положения части второй данного пункта не распространяются на случай назначения комплексной налоговой проверки по заявлению самого налогоплательщика, по основаниям, предусмотренным Уголовно-процессуальным законодательством Республики Казахстан, по требованию органов прокуратуры.

Участники налоговой проверки

Участниками налоговой проверки являются:

1) должностные лица налогового органа, проводящие налоговую проверку;

2) специалисты, привлекаемые налоговым органом к проведению налоговой проверки в соответствии с настоящим Кодексом, указанные в предписании (далее – специалист);

3) проверяемые лица:     

• при тематических налоговых проверках, назначенных не в отношении конкретного налогоплательщика (налогового агента), – налогоплательщик, в том числе государств – членов ЕАЭС и государств, не являющихся членами ЕАЭС, на участке территории, указанном в предписании;

• при других формах налоговых проверок – налогоплательщик (налоговый агент), указанный в предписании.

Для исследования вопросов, требующих специальных знаний и навыков, и получения консультаций налоговый орган вправе привлекать к налоговой проверке специалиста, обладающего такими специальными знаниями и навыками, в том числе должностных лиц иных государственных органов Республики Казахстан.

Тематическая налоговая проверка 

Согласно ст. 156 НК РК тематическая налоговая проверка проводится по вопросам:    

1) исполнения налогового обязательства по отдельным видам налогов и (или) платежей в бюджет;

2) полноты и своевременности исчисления, удержания и перечисления социальных платежей;

3) определения налогового обязательства по действию (действиям) по выписке счета-фактуры, совершение которого (которых) признано судом осуществленным (осуществленными) без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;

4) определения налогового обязательства по взаиморасчетам с налогоплательщиком (налогоплательщиками), в отношении которого (которых) проводится досудебное расследование по факту совершения действий по выписке счета-фактуры без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;

5) определения налогового обязательства по взаиморасчетам с налогоплательщиком (налогоплательщиками), в отношении которого (которых) налоговым органом применено приостановление выписки электронных счетов-фактур в соответствии с подпунктом 1) пункта 1 статьи 88 НК РК;

6) определения взаиморасчетов между налогоплательщиком и его дебиторами;

7) наличия товарно-транспортных накладных на импортируемые и перемещаемые между государствами – членами ЕАЭС товары и соответствия наименования товаров сведениям, указанным в товарно-транспортных накладных;

8) наличия сопроводительных накладных на товары и соответствия наименования, количества (объема) товаров сведениям, указанным в сопроводительных накладных на товары:

• при перемещении, реализации и (или) отгрузке товаров по территории Республики Казахстан, в том числе осуществляемых международными автомобильными перевозками между государствами – членами ЕАЭС;

• при ввозе товаров на территорию Республики Казахстан с территории государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств – членов ЕАЭС;

• при вывозе товаров с территории Республики Казахстан на территорию государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств – членов ЕАЭС;

9) подтверждения наличия остатков товаров, включенных в перечень товаров, к которым применяются пониженные ставки таможенных пошлин в связи с присоединением Республики Казахстан к Всемирной торговой организации;

10) правомерности применения положений международных договоров;

11) подтверждения предъявленного нерезидентом к возврату подоходного налога из бюджета в связи с применением положений международного договора, регулирующего вопросы избежания двойного налогообложения и предотвращения уклонения от уплаты налогов;

12) изложенным в обращении нерезидента, о повторном рассмотрении налогового заявления на возврат подоходного налога из бюджета в связи с применением положений международного договора, регулирующего вопросы избежания двойного налогообложения и предотвращения уклонения от уплаты налогов;

13) наличия документов, предусмотренных нормативными правовыми актами Республики Казахстан, принятыми в реализацию международных договоров при вывозе товаров с территории Республики Казахстан на территорию государств – членов ЕАЭС и соответствия товаров сведениям, указанным в документах;

14) исполнения лицом и (или) структурным подразделением юридического лица требований, установленных настоящим Кодексом, при получении, расходовании денег и (или) иного имущества от иностранных государств, международных и иностранных организаций, иностранцев, лиц без гражданства, в отдельных случаях;

15) наличия и подлинности на товаре средств идентификации по товарам, подлежащим обязательной маркировке в соответствии с международными договорами, ратифицированными Республикой Казахстан, и (или) законодательством Республики Казахстан;

16) соблюдения требований законодательств Республики Казахстан о государственном регулировании производства и оборота отдельных видов подакцизных товаров, а также оборота авиационного топлива, биотоплива, мазута;

17) наличия и подлинности средств идентификации и учетно-контрольных марок;

18) наличия лицензии;

19) постановки на регистрационный учет в налоговых органах;

20) исполнения налогового обязательства по налогу на добавленную стоимость и (или) акцизу по товарам, импортированным на территорию Республики Казахстан с территории государств – членов ЕАЭС;

21) подтверждения достоверности сумм превышения налога на добавленную стоимость, в том числе предъявленных к возврату;

22) подтверждения фактического совершения оборота по реализации товаров, выполнению работ и оказанию услуг;

23) соблюдения порядка выписки электронных счетов-фактур;

24) подтверждения наличия нарушений, указанных в уведомлении о расхождениях, выявленных по результатам камерального контроля;

25) соблюдения требований налоговой регистрации;

26) соблюдения порядка применения контрольно-кассовых машин и (или) трехкомпонентной интегрированной системы;

27) наличия контрольно-кассовых машин и (или) трехкомпонентной интегрированной системы;

28) наличия оборудования (устройства), предназначенного для осуществления платежей с использованием платежных карточек;

29) неисполнения мотивированного решения по мониторингу крупных налогоплательщиков;

30) несогласия с мотивированным решением по горизонтальному мониторингу по вопросам исполнения налогового обязательства и (или) неисполнения такого решения;

31) изложенным в жалобе налогоплательщика (налогового агента) на уведомление о результатах налоговой проверки;

32) исполнения банковскими организациями обязанностей, установленных:     

• Налоговым Кодексом;

• Социальным кодексом Республики Казахстан;

• Законом Республики Казахстан "Об обязательном социальном медицинском страховании";

• иным законодательством Республики Казахстан, контроль за соблюдением которого возложен на налоговые органы;

33) соблюдения законодательства Республики Казахстан о разрешениях и уведомлениях и условий производства, хранения и реализации отдельных видов подакцизных товаров;

34) трансфертного ценообразования;

35) исполнения распоряжения о приостановлении расходных операций по кассе налогоплательщика (налогового агента).

Тематическая налоговая проверка может проводиться одновременно по нескольким вопросам.

3. Налоговые органы не вправе осуществлять тематическую налоговую проверку действий по выписке счета-фактуры, совершение которых судом признано осуществленным без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров, до направления налогоплательщику (налоговому агенту) уведомления о расхождениях, выявленных по результатам камерального контроля и истечения срока его исполнения.

4. По согласованию с объединениями субъектов частного предпринимательства представители таких объединений могут быть привлечены для участия при проведении тематической налоговой проверки, назначенной не в отношении конкретного налогоплательщика (налогового агента).

Представители объединений субъектов частного предпринимательства осуществляют контроль за соблюдением прав налогоплательщика (налогового агента) при проведении указанных тематических налоговых проверок.

5. Тематическая налоговая проверка проводится одновременно по вопросам исполнения налогового обязательства по отдельным видам налогов и (или) платежей в бюджет и подтверждения достоверности сумм превышения налога на добавленную стоимость, в том числе предъявленных к возврату, при назначении по одному из следующих оснований:

1) налогового заявления налогоплательщика о возврате суммы превышения налога на добавленную стоимость для применения порядка возврата превышения суммы налога на добавленную сумму в течение двадцати налоговых периодов равными долями – по подтверждению достоверности сумм превышения налога на добавленную стоимость;

2) требования налогоплательщика о возврате суммы превышения налога на добавленную стоимость, указанной в декларации по налогу на добавленную стоимость, – по подтверждению достоверности сумм превышения налога на добавленную стоимость, предъявленных к возврату.

Срок проведения налоговых проверок

Согласно ст. 163 НК РК срок проведения налоговой проверки, указываемый в предписании налогового органа, не должен превышать 30 рабочих дней с даты вручения предписания, если иное не установлено настоящей статьей.

2. Срок проведения налоговой проверки в отношении юридических лиц, не имеющих структурных подразделений, ИП и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии не более одного места нахождения в РК, назначенной:

1) налоговым органом, может быть продлен:     

• налоговым органом – до 40 рабочих дней;

• вышестоящим налоговым органом – до 50 рабочих дней;

2) уполномоченным органом, может быть продлен до 50 рабочих дней.

3. Срок проведения налоговой проверки в отношении юридических лиц, имеющих структурные подразделения, и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения, при наличии более одного места нахождения в Республике Казахстан, назначенной:

1) налоговым органом, может быть продлен:    

• налоговым органом – до 65 рабочих дней;

• вышестоящим налоговым органом – до 160 рабочих дней;

2) уполномоченным органом, может быть продлен до 160 рабочих дней.

Срок проведения налоговой проверки, указанной в пунктах 2 и 3 выше, не должен превышать 180 календарных дней со дня начала проведения такой проверки.

4. Срок проведения налоговой проверки в отношении налогоплательщиков, состоящих на налоговом мониторинге, назначенной:

1) налоговым органом, может быть продлен:     

• налоговым органом – до 75 рабочих дней;

• вышестоящим налоговым органом – до 180 рабочих дней;

2) уполномоченным органом, может быть продлен до 180 рабочих дней.

В каких случаях назначается налоговая проверка

Налоговая проверка назначается в случаях:

1) подачи налогоплательщиком (налоговым агентом) заявления, требования;

2) наличия оснований, предусмотренных Уголовно-процессуальным кодексом Республики Казахстан;

3) принятия налоговым органом решения о проведении налоговой проверки.

4) истечения срока действия контракта на недропользование, за исключением случаев переоформления права недропользования на лицензионный режим недропользования.

Налоговая проверка проводится на основании предписания.

Налоговая проверка может проводиться за ранее проверенный период.

Налоговая проверка за ранее проверенный период проводится:

1) по заявлению, требованию, жалобе налогоплательщика (налогового агента);

2) по основаниям, предусмотренным Уголовно-процессуальным кодексом Республики Казахстан;

3) на основании решения уполномоченного органа.

В случае подачи налогоплательщиком (налоговым агентом) жалобы в суд на уведомление о результатах налоговой проверки налоговая проверка по обжалуемому вопросу за ранее проверенный период не проводится до вступления в законную силу судебного акта.

Завершение налоговой проверки

1. По завершении налоговой проверки должностным лицом налогового органа, проводившим налоговую проверку, составляется акт налоговой проверки.

      Акт налоговой проверки должен содержать:    

1) место и дату составления;

2) форму проверки, проверяемый период;

3) должности, фамилии, имена и отчества должностных лиц налогового органа, проводивших налоговую проверку;

4) должности, фамилии, имена и отчества представителей объединений субъектов частного предпринимательства, принимавших участие при проведении налоговой проверки;

5) наименование налогового органа;

6) идентификационные данные проверенного налогоплательщика (налогового агента);

7) банковские реквизиты проверенного налогоплательщика (налогового агента);

8) фамилии, имена и отчества руководителя и должностных лиц налогоплательщика (налогового агента), ответственных за ведение налоговой и бухгалтерской отчетности и уплату налогов и платежей в бюджет;

9) сведения о предыдущей проверке и принятых мерах по устранению ранее выявленных нарушений (при проведении комплексной или тематической налоговой проверки);

10) общие сведения о документах, представленных проверенным налогоплательщиком (налоговым агентом);

11) подробное описание выявленных нарушений с указанием соответствующих положений законодательства Республики Казахстан, требования которых нарушены;

12) результаты проверки.

К акту налоговой проверки прилагаются необходимые копии документов, расчеты, произведенные должностным лицом налогового органа, проводившим налоговую проверку, и другие материалы, полученные в ходе налоговой проверки, за исключением сведений, являющихся налоговой тайной.

2. Акт налоговой проверки составляется в количестве не менее двух экземпляров и:

1) подписывается должностными лицами налогового органа, проводившими такую проверку, – в случае его вручения лично под роспись;

2) удостоверяется посредством электронной цифровой подписи должностных лиц налогового органа, проводивших такую проверку, – в случае его вручения электронным способом.

3. Завершением срока налоговой проверки считается день вручения проверенному налогоплательщику (налоговому агенту) акта налоговой проверки.

      Акт налоговой проверки представляется проверенному налогоплательщику (налоговому агенту).    

4. В случае невозможности вручения акта налоговой проверки лично под роспись проверенному налогоплательщику (налоговому агенту) в связи с его отсутствием по месту нахождения проводится налоговое обследование с привлечением понятых и производится соответствующая запись в акте налоговой проверки.

      Датой вручения акта налоговой проверки является дата составления акта налогового обследования.

5. При отказе проверенного налогоплательщика (налогового агента) от получения акта налоговой проверки производится соответствующая запись в акте налоговой проверки и составляется акт об отказе в получении акта налоговой проверки.

      Датой вручения акта налоговой проверки является дата составления акта об отказе в получении акта налоговой проверки.

6. В случае, если за период с даты получения ликвидационной налоговой отчетности до даты завершения ликвидационной налоговой проверки возникают налоговое обязательство по исчислению, уплате налогов, платежей в бюджет и социальное обязательство, такие обязательства указываются в приложении к акту налоговой проверки без начисления пеней и применения штрафных санкций.

Тематическая проверка до 1 января 2026 года

Налоговая проверка - это проверка, осуществляемая налоговым органом, исполнения норм налогового законодательства Республики Казахстан, а также иного законодательства Республики Казахстан, контроль за исполнением которого возложен на налоговые органы. (ст. 138 Налогового кодекса РК).

Налоговые проверки осуществляются исключительно налоговыми органами.

На основании ст. 140 НК РК налоговые проверки осуществляются в форме:

• комплексной, 

• тематической, 

• встречной проверки, 

• хронометражного обследования. 

Согласно ст. 142 НК РК тематической проверкой является проверка,  проводимая налоговым органом в отношении налогоплательщика (налогового агента), по вопросам:
1) исполнения налогового обязательства по отдельным видам налогов и (или) платежей в бюджет;
2) исполнения налогового обязательства по НДС и (или) акцизу по товарам, импортированным на территорию РК с территории государств-членов ЕАЭС;
3) определения налогового обязательства по действию (действиям) по выписке счета-фактуры, совершение которого (которых) признано судом осуществленным (осуществленными) без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;
3-1) определения налогового обязательства по взаиморасчетам с налогоплательщиком (налогоплательщиками), в отношении которого (которых) проводится досудебное расследование по факту совершения действий по выписке счета-фактуры без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;
4) определения взаиморасчетов между налогоплательщиком и его дебиторами;
5) правомерности применения положений международных договоров (соглашений);
6) подтверждения достоверности сумм превышения налога на добавленную стоимость, в том числе предъявленных к возврату;
7) подтверждения предъявленного нерезидентом к возврату подоходного налога из бюджета в связи с применением положений международного договора, регулирующего вопросы избежания двойного налогообложения и предотвращения уклонения от уплаты налогов;
8) изложенным в обращении нерезидента, о повторном рассмотрении налогового заявления на возврат подоходного налога из бюджета в связи с применением положений международного договора, регулирующего вопросы избежания двойного налогообложения и предотвращения уклонения от уплаты налогов;
9) неисполнения налогоплательщиком (налоговым агентом) уведомления налоговых органов об устранении нарушений, выявленных по результатам камерального контроля, в порядке, определенном статьей 96 настоящего Кодекса;
10) исполнения требований, предусмотренных статьей 29 настоящего Кодекса;
11) изложенным в жалобе налогоплательщика (налогового агента) на уведомление о результатах проверки;
12) постановки на регистрационный учет в налоговых органах;
13) наличия ККМ или трехкомпонентной интегрированной системы;
14) наличия оборудования (устройства), предназначенного для осуществления платежей с использованием платежных карточек;
15) наличия СНТ и соответствия наименования, количества (объема) товаров сведениям, указанным в СНТ:
при перемещении, реализации и (или) отгрузке товаров по территории РК, в том числе осуществляемых международными автомобильными перевозками между государствами-членами ЕАЭС;
при ввозе товаров на территорию РК с территории государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств-членов ЕАЭС;
при вывозе товаров с территории РК на территорию государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств-членов ЕАЭС;
16) наличия документов, предусмотренных нормативными правовыми актами Республики Казахстан, принятыми в реализацию международных договоров, ратифицированных Республикой Казахстан, при вывозе товаров с территории РК на территорию государств-членов ЕАЭС и соответствия товаров сведениям, указанным в документах;
17) наличия и подлинности акцизных и учетно-контрольных марок, наличия лицензии;
18) наличия товарно-транспортных накладных на импортируемые товары и соответствия наименования товаров сведениям, указанным в товарно-транспортных накладных, при проверке автотранспортных средств на постах транспортного контроля или дорожной полиции;
19) соблюдения порядка применения контрольно-кассовых машин;
20) соблюдения законодательства РК о разрешениях и уведомлениях и условий производства, хранения и реализации отдельных видов подакцизных товаров;
21) исполнения распоряжения, вынесенного налоговым органом, о приостановлении расходных операций по кассе;
22) соблюдения порядка выписки счетов-фактур в электронной форме;
23) подтверждения наличия остатков товаров, включенных в перечень товаров, к которым применяются пониженные ставки таможенных пошлин в связи с присоединением Республики Казахстан к Всемирной торговой организации;
24) неисполнения решения в рамках мониторинга крупных налогоплательщиков;
25) наличия и подлинности на товаре средства идентификации по товарам, подлежащим обязательной маркировке в соответствии с международными договорами и (или) законодательством РК.

Тематическая проверка может также проводиться по следующим вопросам:

1) полноты и своевременности исчисления, удержания и перечисления социальных платежей;
2) исполнения банками и организациями, осуществляющими отдельные виды банковских операций, обязанностей, установленных настоящим Кодексом, а также законами Республики Казахстан "Об обязательном социальном страховании" и "О пенсионном обеспечении в Республике Казахстан", "Об обязательном социальном медицинском страховании";
3) трансфертного ценообразования;
4) государственного регулирования производства и оборота отдельных видов подакцизных товаров, а также оборота авиационного топлива, биотоплива, мазута.
3. Тематическая проверка может проводиться одновременно по нескольким вопросам, указанным в пунктах 1 и 2 настоящей статьи. Тематическая проверка не может предусматривать проведение проверки исполнения обязательства по всем видам налогов и платежей в бюджет.

Срок проведения налоговой проверки не должен превышать 30 рабочих дней с даты вручения предписания.

Срок проведения налоговой проверки может быть продлен:

- для юридических лиц, не имеющих структурных подразделений, индивидуальных предпринимателей и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии не более одного места нахождения в РК,

• налоговым органом, назначившим налоговую проверку, - до 45 рабочих дней;

• вышестоящим органом налоговой службы - до 60 рабочих дней;

- для юридических лиц, имеющих структурные подразделения, и нерезидентов, осуществляющих деятельность через постоянные учреждения при наличии более одного места нахождения в РК, а также для крупных налогоплательщиков, подлежащих мониторингу:

• налоговым органом, назначившим налоговую проверку, - до 75 рабочих дней;

• вышестоящим органом налоговой службы - до 180 рабочих дней.

Правила назначения тематических и встречных проверок и вынесения решения о проведении хронометражного обследования. Приказ Министра финансов Республики Казахстан от 15 февраля 2018 года № 197.