Система управления налоговыми рисками – это комплекс мероприятий, проводимых налоговым органом при налоговом администрировании с целью выявления налоговых рисков, определения мер по их минимизации.

Налоговый риск – вероятность неисполнения налогового законодательства Республики Казахстан и иного законодательства Республики Казахстан, контроль за соблюдением которого возложен на налоговые органы.

Новый Налоговый кодекс (Кодекс РК от 18 июля 2025 года № 214-VIII ЗРК) вступил в силу с 1 января 2026 года.

В рамках налоговой реформы изменения, вступающие в силу с 1 января 2026 года, коснулись обновления системы управления налоговыми рисками. 

В новой модели полностью отказались от деления налогоплательщиков на степени риска (высокий, средний, низкий). 

Введены меры по минимизации налогового риска при налоговом администрировании: предупредительные и контрольные. 

Меры реализуются на базе автоматизированной информационной системы (АИС) налогового органа.


Согласно ст. 93 Налогового кодекса предупредительные меры по минимизации налогового риска осуществляются путем:

  • информирования налогоплательщиков (налоговых агентов) о наступлении сроков представления налоговых форм, 

  • уплаты налогов и платежей в бюджет, 

  • налоговой регистрации, и (или) 

  • необходимости исполнения иных налоговых обязательств.

Контрольные меры по минимизации налогового риска осуществляются путем:

Применение мер по минимизации налогового риска к налогоплательщику (налоговому агенту) определяется в том числе с использованием автоматизированной информационной системы налогового органа.

Порядок организации управления налоговыми рисками определяется уполномоченным органом.

Информация, полученная при управлении налоговыми рисками, а также порядок организации управления налоговыми рисками являются конфиденциальной информацией, доступ к которой ограничен законодательством Республики Казахстан.

Должностные лица налоговых органов используют полученную информацию исключительно для выполнения задач и функций, возложенных на налоговый орган, и не вправе распространять ее как в период исполнения ими своих обязанностей, так и после завершения их выполнения.

Предоставление указанной информации иным лицам, в том числе налогоплательщикам, запрещается.

Камеральный контроль

Камеральный контроль – мероприятие, осуществляемое налоговым органом на основе изучения и анализа налоговых форм, а также других документов и сведений о деятельности налогоплательщика (налогового агента).

Целью камерального контроля является предоставление налогоплательщику (налоговому агенту) права самостоятельного исполнения налоговых обязательств по исчислению налогов и платежей в бюджет.

Камеральный контроль проводится путем сопоставления данных, содержащихся в:

1) сведениях, имеющихся в налоговых органах, в том числе налоговых формах;

2) сведениях иных уполномоченных государственных органов об объектах налогообложения и (или) объектах, связанных с налогообложением;

3) сведениях о деятельности налогоплательщика (налогового агента), полученных из различных источников информации.

Срок проведения камерального контроля

Согласно ст. 137 НК РК камеральный контроль проводится налоговым органом за соответствующий налоговый период после истечения срока представления налоговой отчетности, установленного настоящим Кодексом.

Камеральный контроль за налоговый период проводится в течение срока исковой давности по такому периоду.

При выявлении расхождений по результатам камерального контроля налогоплательщику (налоговому агенту), за исключением участника горизонтального мониторинга, представляется уведомление о расхождениях, выявленных по результатам камерального контроля (далее в целях настоящей статьи – уведомление).

Контроль выписки ЭСФ 

Контроль выписки ЭСФ проводится в целях пресечения выписки ЭСФ с высоким риском.

В Налоговом кодексе предусмотрено 2 вида контроля выписки ЭСФ:

  1. автоматизированный контроль;
  2. сопоставительный контроль.

Автоматизированный контроль выписки ЭСФ

Автоматизированный контроль представляет собой автоматизированный процесс присвоения в информационной системе налогового органа регистрационного номера ЭСФ, выписанному налогоплательщиком, отнесенному к отдельной категории налогоплательщиков. (ст. 139 НК РК)

Категории налогоплательщиков, в отношении которых проводится автоматизированный контроль, утверждаются уполномоченным органом.

Правила проведения автоматизированного контроля также устанавливаются уполномоченным органом и должны содержать:

  1. порядок ведения налогового счета;
  2. порядок учета балансовой суммы налога;
  3. порядок пополнения плательщиком налога налогового счета;
  4. порядок перечисления в бюджет денег плательщика налога, использованных для выписки электронного счета-фактуры;
  5. порядок и сроки подачи и рассмотрения заявления плательщика налога о возврате денег;
  6. порядок возврата денег плательщику налога;
  7. период проведения автоматизированного контроля.

Важно отметить, что каждому ЭСФ присваивается регистрационный номер. В случае, если ЭСФ не присвоен регистрационный номер, он считается не выписанным.

Сопоставительный контроль выписки ЭСФ

Согласно ст. 141 НК РК сопоставительный контроль - мероприятие, осуществляемое налоговым органом путем сопоставления выписанных налогоплательщиком электронных счетов-фактур с данными:

  1. электронных счетов-фактур, выписанных его поставщиками;
  2. налоговой отчетности;
  3. сведений иных уполномоченных государственных органов по деятельности налогоплательщика, в том числе об объектах налогообложения и (или) объектах, связанных с налогообложением;
  4. сведений банков второго уровня по банковским счетам.

Цель проведения сопоставительного контроля выписки ЭСФ - установление фактического совершения оборота по реализации товаров, оказанию работ и услуг.

Сопоставительный контроль осуществляется по выписанным в пределах срока исковой давности ЭСФ.

Если по результатам проведенного сопоставительного контроля у налогового органа возникают сомнения в фактическом совершении операций по реализации товаров, выполнению работ и оказанию услуг, то налогоплательщику представляется уведомление о подтверждении фактического совершения оборота по реализации товаров, выполнению работ и оказанию услуг.

Налоговый контроль

Налоговый контроль осуществляется путем проведения налоговой проверки исключительно налоговыми органами.

Общий порядок проведения налоговой проверки определяется Налоговым Кодексом, а также Предпринимательским кодексом Республики Казахстан.

Налоговая проверка осуществляется в форме:

  • комплексной, 

  • тематической, 

  • встречной налоговой проверки, 

  • хронометражного обследования.

Период, подлежащий налоговой проверке, не должен превышать срок исковой давности.

Налоговые органы вправе осуществлять налоговые проверки структурных подразделений юридического лица независимо от проведения налоговой проверки самого юридического лица.

Налоговая проверка в отношении сотрудников органов, осуществляющих в соответствии с Законом Республики Казахстан "Об оперативно-розыскной деятельности" оперативно-розыскную деятельность, проводится в особом порядке.

Особый порядок проведения налоговой проверки определяется уполномоченным органом совместно со специальными государственными органами, органами военной разведки Министерства обороны Республики Казахстан, правоохранительными органами.

При определении проверяемого периода не включается налоговый период, охваченный аудитом по налогам, при назначении:

1) комплексной налоговой проверки, за исключением назначаемых при реорганизации или ликвидации юридического лица – резидента, структурного подразделения юридического лица – нерезидента;

2) тематической налоговой проверки по налоговому заявлению или жалобе самого налогоплательщика (налогового агента), в том числе:    

  • по налоговому заявлению в связи со снятием с регистрационного учета плательщика по налогу на добавленную стоимость;

  • в связи с жалобой налогоплательщика (налогового агента) на уведомление о результатах налоговой проверки.

Положение части первой данного пункта не распространяется на налоговые проверки в отношении:

      1) налогоплательщиков, подлежащих налоговому мониторингу;

      2) недропользователей;

      3) налогоплательщиков, осуществляющих виды деятельности по производству и обороту отдельных видов подакцизной продукции, биотоплива.

Налоговая проверка назначается  с учетом показателя коэффициента налоговой нагрузки (КНН).

При этом комплексная налоговая проверка не назначается за налоговый период, в котором у налогоплательщика КНН составляет не менее 90 процентов верхнего показателя КНН по соответствующему виду деятельности и с учетом региона осуществления деятельности.

Положения части второй данного пункта не распространяются на случай назначения комплексной налоговой проверки по заявлению самого налогоплательщика, по основаниям, предусмотренным Уголовно-процессуальным законодательством Республики Казахстан, по требованию органов прокуратуры.

Участниками налоговой проверки являются:

1) должностные лица налогового органа, проводящие налоговую проверку;

2) специалисты, привлекаемые налоговым органом к проведению налоговой проверки в соответствии с настоящим Кодексом, указанные в предписании (далее – специалист);

3) проверяемые лица:     

  • при тематических налоговых проверках, назначенных не в отношении конкретного налогоплательщика (налогового агента), – налогоплательщик, в том числе государств – членов ЕАЭС и государств, не являющихся членами ЕАЭС, на участке территории, указанном в предписании;

  • при других формах налоговых проверок – налогоплательщик (налоговый агент), указанный в предписании.

Для исследования вопросов, требующих специальных знаний и навыков, и получения консультаций налоговый орган вправе привлекать к налоговой проверке специалиста, обладающего такими специальными знаниями и навыками, в том числе должностных лиц иных государственных органов Республики Казахстан.