Естественная убыль товара, сырья, материалов представляет собой естественные потери в весе и объеме от усушки, утечки, утруски, распыления, выдувания и т.п. Эти потери образуются при хранении, погрузке и разгрузке, перевале, розливе, уварки и т.д.

Уполномоченным органом утверждены нормативы естественной убыли, по которым определяются количество и стоимость безвозвратно утраченных товарно-материальных ценностей. При отсутствии утвержденных нормативов, организация сама разрабатывает и утверждает свои нормативы естественной убыли запасов. В любом случае нормативы естественной убыли должны быть отражены в учетной политике организации. При отсутствии норм убыль запасов рассматривается как недостача сверх норм. Потери от естественной убыли списываются на основании актов или бухгалтерских справок по формам, утвержденным учетной политикой организации.

К естественной убыли не относятся потери ТМЗ сверх норм естественной убыли. Такие потери расцениваются как недостачи с соответствующим их оформлением в бухгалтерском учете. Потери от недостач относятся на расходы, не идущие на вычеты при определении налогооблагаемого дохода.

Порядок определения, а также учет потерь в пределах норм естественной убыли должен быть предусмотрен учетной политикой организации.

В соответствии с Законом РК "О бухгалтерском учете и финансовой отчетности", учетная политика представляет собой принципы, основы, условия, правила и практику, принятые организацией для ведения бухгалтерского учета и составления финансовой отчетности в соответствии с требованиями законодательства Республики Казахстан о бухгалтерском учете и финансовой отчетности, стандартами бухгалтерского учета и Типовым планом счетов бухгалтерского учета, исходя из потребностей организации и особенностей ее деятельности.

На затраты, включаемые в себестоимость продукции, относятся безвозвратные отходы.

При этом безвозвратными считаются отходы, которые не могут быть использованы при данном состоянии техники, и технологические потери, угары, усушка, улетучивание и т. п. При этом, по Правилам ведения бухгалтерского учета нормы естественной убыли применяются лишь в случаях выявления фактических недостач.

Таким образом, налогоплательщики, не являющиеся естественными монополистами, определяют нормы естественной убыли, применимые для учета потерь товарно-материальных запасов, исходя из специфики производства, по учетной политике.  На вычеты по КПН естественная убыль относится на вычеты только, если по данным бухгалтерского учета списание в пределах норм естественной убыли относится на производственную себестоимость. Если не относится на производственную себестоимость, на вычеты не относится.

Все недостачи и потери делятся на две категории: нормируемые и ненормируемые.

Нормируемые потери представляют собой естественную убыль количественных характеристик товара (масса, длина, объем), которая обусловлена изменениями биологических или физико-химических свойств при сохранении качества товара, таких как: усушка, утечка, утруска, распыление, выдувание и  т.д. Нормируемые потери обычно возникают в ходе деятельности предприятия, и избежать их не представляется возможным.

Ненормируемые потери представляют собой потери от выявленных недостач, порчи, хищений, боя, брака, и т.д. Ненормируемые потери возникают при нарушении условий хранения или изготовления, противоправных действий (халатное отношение, хищение), чрезвычайных ситуаций.  Такие потери не связаны с деятельностью предприятия.

Как указано в  п. 71  Правил ведения бухгалтерского учета - выявленные при инвентаризации расхождения фактического наличия имущества с данными бухгалтерского учета, признаются: излишки - доходом и подлежат оприходованию, недостачи - расходом или, в случае установления виновного лица, его задолженностью.

Результаты инвентаризации должны быть отражены в бухгалтерском учете и финансовой отчетности того месяца, в котором была закончена инвентаризация, а по годовой инвентаризации - в годовой финансовой отчетности. 

Естественная убыль списывается в фактически обнаруженных размерах, но не выше установленных норм. Прочие недостачи и сверхнормативные потери списываются в фактических размерах. 

Согласно ст. 243 Налогового кодекса - Потери товаров, понесенные налогоплательщиком, за исключением случаев, предусмотренных пунктом 2 статьи 243 НК РК, подлежат вычету в пределах норм естественной убыли, установленных законодательством Республики Казахстан.

Согласно пп. 1 ст. 264 Налогового кодекса - сверхнормативные потери не подлежат вычету, как затраты, не связанные с деятельностью, направленной на получение дохода.

При исчислении НДС, согласно пп. 2 п. 2 ст. 404 Налогового кодекса производится уменьшение суммы НДС, относимого в зачет по товарам в случае их порчи, утраты (за исключением случаев, возникших в результате чрезвычайных ситуаций и (или) в период действия чрезвычайного положения). При этом порча товара означает ухудшение всех или отдельных качеств (свойств) товара, в результате которого данный товар не может быть использован для целей облагаемого оборота. Под утратой товара понимается событие, в результате которого произошли уничтожение или потеря товара. Не является утратой потеря товаров, понесенная налогоплательщиком в пределах норм естественной убыли, установленных законодательством Республики Казахстан;

При порче, утрате товаров в случаях, возникших в результате чрезвычайных ситуаций, уменьшение суммы налога на добавленную стоимость, относимого в зачет, не производится при наличии подтверждения уполномоченного органа в сфере гражданской защиты о факте возникновения чрезвычайной ситуации по товарам, по которым имеются:

• документ, подтверждающий факты порчи, утраты товара, оформленный в соответствии с законодательством Республики Казахстан о бухгалтерском учете и финансовой отчетности;

• сведения, отраженные в налоговом регистре, составленном в соответствии с пунктом 7-1 статьи 215 настоящего Кодекса.

При порче, утрате товаров в случаях, возникших в период действия чрезвычайного положения, уменьшение суммы налога на добавленную стоимость, относимого в зачет, не производится при наличии копии постановления органа, ведущего уголовное преследование, о признании налогоплательщика потерпевшим по уголовным делам, связанным с чрезвычайным положением, по товарам (за исключением товаров, по которым получены деньги на возмещение имущественного вреда, причиненного в период действия чрезвычайного положения, по решению комиссии, созданной местным исполнительным органом, при включении налогоплательщика в реестр, формируемый указанным местным исполнительным органом), по которым имеются:

• документ, подтверждающий факты порчи, утраты товара, оформленный в соответствии с законодательством Республики Казахстан о бухгалтерском учете и финансовой отчетности;

• сведения, отраженные в налоговом регистре, составленном в соответствии с пунктом 7-1 статьи 215 настоящего Кодекса;

Корректировка суммы налога на добавленную стоимость, относимого в зачет, в случаях, установленных подпунктами 1), 2), 3), 4) и 5) пункта 2 и пунктом 3 статьи 404 Налогового кодекса, производится в том налоговом периоде, в котором наступили такие случаи.