ТОО заключила с типографией  договор на изготовление печатной продукции.  После того как они выполнили заказ, ТОО произвела полную оплату услуг  типографии, но их сторона не выдала нам счет-фактуру и накладную.  Какие меры надо предпринять?

Вести переговоры, требовать документы. В крайнем случае, обратиться в суд.

Считаем, что  такие проблемы решаются на уровне руководства.