Может ли контрагент выдавать счёт-фактуры с буквенными инициалами?  

Ответ:

По п. 5 ст. 263 НК в счете-фактуре, выписываемом на бумажном носителе, должны быть указаны: в отношении индивидуальных предпринимателей, являющихся поставщиками или получателями товаров, работ, услуг, - фамилия, имя, отчество (если оно указано в документе, удостоверяющем личность) и (или) наименование налогоплательщика, указанное в свидетельстве о постановке на регистрационный учет ...